氨基酸奶粉最大的好处是避免儿童由于牛奶蛋白过敏造成腹泻、营养不良等症状。很多儿童会有过敏性的体质，主要是由于先天的遗传因素或后天的不良原因引起，比如儿童出生以后应用抗菌药物过多等等因素，都会造成儿童出现对牛奶蛋白过敏的情况。儿童如果吃普通的婴幼儿配方奶粉，会出现腹痛、腹泻以及大便中带有血丝等症状，如果不进行干预治疗，儿童就会出现脱水、电解质紊乱以及营养不良等后果。氨基酸奶粉是由牛奶蛋白经过深度水解以后，制成的特殊类型奶粉，不会引起儿童出现过敏的情况。